Cette grotte, située en domaine privé en surplomb du quai Jean-Jacques Rousseau, est représentée dans de très nombreuses éditions des Confessions.
Jean-Jacques Rousseau y passa une nuit à la belle étoile lors d’un passage à Lyon en 1732. A l’époque de Rousseau, le fleuve était bordé d’un chemin de halage, dénommé Chemin des Etroits, très apprécié comme lieu de promenade et jalonné de très belles demeures.
En 3 siècles, le cours des fleuves s’est considérablement modifié et notamment le confluent n’a cessé de se déplacer vers le Sud.
Au XVIIIème, le Rhône et la Saône se rejoignaient au nord de Perrache, à Ainay. La grotte de Jean Jacques Rousseau était donc située face au Rhône, alors qu’aujourd'hui ce sont les eaux de la Saône qui baignent cette rive.
Le quai ne s’est substitué au chemin qu’assez tardivement, sous le règne de Louis-Philippe. Il prit le nom de l’écrivain en 1888. La grotte fut un lieu de pèlerinage tout au long du XIXe siècle pour des écrivains, des poètes et des artistes.